설립이전 선산군 선산읍에는 완전리농업협동조합 등 19개의 이동조합이 있었으나 그 규모가 영세하여 먼저 서부리농업협동조합(내고1·2리, 북산 1·2리)으로 먼저 신설합병하고 읍면단위 합병계획에 따라 16개리 이동조 합에 대하여 합병을 실시하고 1972.08.30 창립하여 선산읍 완전리 215-3 번지에 선산동농업협동조합(善山洞農業協同組合)으로 탄생하였다.

1973.03.05 조합명칭을 선산단위농업협동조합(善山單位農業協同組合)으로 변경하고 1974.11월 현위치로 주사무소를 이전하여 1989.04.10 조합명칭 을 선산농업협동조합(善山農業協同組合)으로 변경하여 2018년 3월 30일을 기준하여 현재까지 선산읍과 옥성면을 관할하는 농협으로 성장하였다.

설립초기 선산농협은 이동합병으로 인하여 서부리농업협동조합에서 취득 한 선산읍 북산리 288, 288-5번지에 비료창고 2동(40평, 42평)을 기반으로 사무실은 선산읍 완전리 215-3번지에서(현 구미·칠곡 축협 선산지점 위치) 8평을 임대하여 각종업무를 추진하다가, 1974.10.27. 2층 규모의 종합시설 (사무실,연쇄점,창고)187.4평을 신축하여 주사무소를 구미시 선산읍 완전리 252-1번지에 이전하여 업무를 개시하고 1974.11.20. 연쇄점을 개점하였다. 1976.06.16. 선산읍 화조리와 죽장리에 양곡창고 200평과 100평을 신축하고 1976.07.24. 북산리에 양곡창고 100평, 1978.09.30. 화조리에 비료창고 100평 을 구·판사업용으로 건립하였다.

1982년 농협중앙회 선산군지부로부터 이문리 도정공장 1동(97평), 도정 공장 창고시설 1동(88평), 동부리 비료창고 1동(111평), 낙화생가공공장 1동(17평)의 고정자산을 인수하였다.

1983.02.15. 행정구역개편으로 7개리(금릉군 감문면의 봉남 1·2리, 소재 리와 선산군 옥성면의 포상1·2리, 봉곡1·2리) 업무구역을 조정하여 조합원 413명을 편입하고, 옥성농협으로부터 1983.02.28. 포상리에 양곡창고 100평을 인수하였으며, 1984.12.31. 화조리에 비료창고 100평과 관리사를 신축하여 지역주민들의 편익을 제공하였다.

1986.10.02. 주사무소 주소지를 구미시 선산읍 완전리 252-3번지(남문로 19)로 변경하고 1989.04.10 조합명칭을 선산농업협동조합으로 변경하였다. 1991.01.30. 상호금융예수금 100억원을 달성한 후 1992.05.18. 이문지소를 개점하고, 1993.09.18. 농업인들의 숙원사업인 산물벼 수매를 일관 처리하는 미곡종합처리장과 보관창고 및 부속시설을 선산읍 화조리 193-1번지 (조남로159) 외 5필지 3,630평의 대지위에 건립하여 농업인 조합원들의 쌀 판매에 대한 근심을 해소하게 되었다.

또한 산물벼 수매 시 농업인조합원들의 원료곡 투입 대기시간을 단축하기 위하여 2004년, 2007년 두 차례에 걸쳐서 고품질 쌀 생산과 노후화 시설을 현대화하기 위한 투입구 등 각종시설 보완공사, 조선기 2기, 호퍼사일로 400톤 2기, 연속식건조기 1기를 추가로 설치하여 8시간정도 대기시간을 단축하였다.

식자재업체인 (주)LG아워홈과 (주)삼성에버랜드에 위생적으로 청결미를 납품하기 위하여 2010년에는 정미기시설 등을 대대적으로 보수공사를 실시하고 보관시설인 평사일로 5기, 호퍼사일로 2기, 보관창고 1동 에 대 하여 냉각장치 공사를 실시하여 원료곡과 청결미를 저온저장시설에 보관 할 수 있도록 하였다.

조합원의 복지 및 편익 등을 위하여 주사무소 이전 예정지 구미시 선산읍 이문리 162번지(선산읍중앙로 8)에 270여평의 영농자재종합백화점을 먼저 개점하여 농업인들의 영농에 필요한 영농자재를 공급하고 지상 3층, 지하 1층 연면적 700평 규모에 금융사무소, 예식장, 회의실, 연쇄점등을 고루 갖 춘 종합청사를 신축하고 이전하여 1997.11.21. 업무를 개시하였다.

경영합리화를 위하여 1998.03.11. 이문지소를 완전리 252-3번지(남문로 19) 이전하여 지사무소명칭을 중앙지점으로 변경하고 선산읍 교리에 있는 구미시 산림조합의 건물을 매입하여 교리지점을 1998.07.16. 개점 후 IMF 이후 경영이 악화되어 경영합리화를 위하여 2002.03.25. 폐점하였다.

농업인들의 농기계에 사용하는 농업용 면세유류와 차량용유류, 난방용유류 등 양질의 유류를 공급할 수 있도록 선산읍 동부리 19번지(선산대로 1432)에 주유소를 2000.09.05 개점하여 배달용 유조차 4대를 운영하고 유류탱크(휘발유 9만리터, 경유 23만리터, 실내등유 4만리터)를 매설하여 지역사회의 유류 가격을 조정할 수 있는 역할을 하게 되어 지역주민들로부터 찬사를 받고 있으며 선산읍과 옥성면을 관할하는 종합농협으로 역할을 다하여 성장하고 있다.

3월 30일을 기준으로 하여 옥성농협을 흡수합병하여 현재는 43개리를 관할하는 농협으로 발전하였으며 2025년 12월 31일 기준 총조합원수 2,860명으로서 선산읍과 옥성면을 관할하는 종합농협으로 역할을 다하여 성장하고 있다.

(단위:개,동,대)